La certification biologique du CBD garantit que le chanvre est cultivé sans pesticides ni engrais chimiques de synthèse, conformément au règlement européen (UE) 2018/848 relatif à la production biologique. En France, les organismes certificateurs agréés incluent Ecocert, Bureau Veritas et Certipaq Bio.
La certification AB (Agriculture Biologique) ou Eurofeuille implique un contrôle annuel des exploitations et de la chaîne de transformation. Pour le CBD, les exigences couvrent les semences (variétés inscrites au catalogue européen), les pratiques culturales (rotation, fertilisation organique), la transformation (absence de solvants chimiques) et la traçabilité. Le surcoût de production bio est estimé à 20-30 %, mais génère un premium prix de 30-50 % sur le marché final.