Le génotype désigne le patrimoine génétique complet (ADN) d'une plante de cannabis. Il détermine le potentiel de la plante en termes de taux de cannabinoïdes, profil terpénique, morphologie et résistance aux maladies.
Le génotype fixe les limites, mais c'est l'environnement qui détermine jusqu'où le potentiel sera exprimé (phénotype). Une génétique premium cultivée dans de mauvaises conditions donnera un résultat médiocre. Les banques de graines garantissent la stabilité du génotype de leurs variétés.