Les acides gras oméga-3 du chanvre comprennent l'acide alpha-linolénique (ALA, 15-20 % des lipides totaux) et l'acide stéaridonique (SDA, 1-2 %). L'huile de chanvre présente un ratio oméga-6/oméga-3 de 3:1, considéré comme optimal par l'OMS et l'EFSA pour la prévention cardiovasculaire et la réduction de l'inflammation systémique.
Selon une étude de Nutrition & Metabolism (Callaway, 2004), la consommation régulière d'huile de chanvre améliore le profil lipidique sanguin et réduit les marqueurs inflammatoires. L'huile de chanvre contient également de l'acide gamma-linolénique (GLA, 3-5 %), un oméga-6 anti-inflammatoire rare, présent aussi dans l'huile d'onagre et de bourrache. L'ANSES recommande un apport quotidien de 2 g d'ALA, soit environ 10 ml d'huile de chanvre.